Bajo mi punto de vista lo unico que debes hacer es borrar los datos del
combo antes de cargarlo. Simplemente pon la linea
self.cmb_origen .Clear()
antes del bulce for, te quedaria algo asi
res = cursor.fetchall()
self.cmb_origen.Clear()
for reg in res:
self.cmb_origen.Append(reg[0])
db.commit()
db.close()
return #end function